劉國才
所長、黨委書記 教授
男，漢族，1965年4月出生，中共黨員，研究生學歷，博士學位，教授。
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李維新
副所長 研究員 博士生導師
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孔令輝
副所長 研究員
男，漢族，1969年8月出生，中共黨員，研究生學歷，碩士學位，研究員。
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朱風松
紀委書記
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1978年
江蘇省革委會決定成立江蘇省環境科學研究所。
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1983年
江蘇省環境科學研究所更名為：城鄉建設部南京環境科學研究所。
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1988年
原城鄉建設環境保護部撤銷，更名為：國家環境保護局南京環境科學研究所。
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1998年
原國家環境保護局升級為國務院直屬總局，更名為：國家環境保護總局南京環境科學研究所。
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2008年
國務院機構改革，成立環境保護部，更名為：環境保護部南京環境科學研究所。
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2018年
國務院機構改革，環境保護部組建為生態環境部，更名為：生態環境部南京環境科學研究所。
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